methylation是什么意思,methylation中文翻譯,methylation發(fā)音、用法及例句
?methylation
methylation發(fā)音
英:[meθ?'le??n] 美:[meθ?'le??n]
英: 美:
methylation中文意思翻譯
n. 甲基化作用
methylation常見(jiàn)例句
1 、Acetic acid methyl amyl ester.───乙酸甲基戊酯。
2 、One kind of methylation alteration is that the unmethylated CCGG sequence was transformed into external hemimethylated cytosines.───一類(lèi)變異是將未甲基化CCGG位點(diǎn)的外側胞嘧啶半甲基化,此類(lèi)變異基本上不能傳遞給再生苗;
3 、Methylation status of E-cad in 60 primary ACC was also examined by the same method.───同法從60例ACC 組織切片中刮取腫瘤細胞,檢測E-cad 基因甲基化狀況。
4 、But what happens if the methyl defense falters?───如果說(shuō)這種甲基防御出了問(wèn)題,又會(huì )發(fā)生什么事呢?
5 、The investigation on the role of DNA methylation in carcinogenesis have been mainly focused on promoter hypermethylation of tumor suppressor genes.───關(guān)于DNA甲基化在腫瘤中的作用的研究,大多集中在研究已知的抑癌基因啟動(dòng)子區的異常高甲基化。
6 、Aberrant DNA methylation reinforce the gastrical tumorigenesis by promoting gene mutation and enhancing the chromatosome instability ,etc.───DNA的異常甲基化通過(guò)影響基因轉錄,促基因突變,增加染色體結構的不穩定性等多方面促進(jìn)胃癌的發(fā)生發(fā)展。
7 、To combine with the methyl radical.───使甲基化使與甲基根結合
8 、Decitabine is the most common medicament used to reduce the level of methylation.───地西他濱是用于降低甲基化的常用藥物。
9 、The abnormality of DNA methylation includes global hypomethylation and region-specific hypermethylation.───DNA甲基化異常包括全基因組的低甲基化和局部基因的高甲基化。
10 、CRL was reacted much more quickly with methyl 5-N-(2, 6-xylyl)-alanate than that with R isomer.───CRL脂酶對S-(-)-N-(2,6-二甲苯基)-丙氨酸甲酯作用速度遠大于R-(+)-異構體。
11 、Methylation within the NF2 promoter region was only identified at a single CpG site in one tumor sample.───NF2啟動(dòng)子區域甲基化只在一例腫瘤樣品中單個(gè)CpG位點(diǎn)中檢測到。
12 、P15 gene methylation might be related with the pathogenesis, and prognosis of MM.───p15基因甲基化可能是MM發(fā)病的原因之一,與MM的發(fā)展及預后有一定的關(guān)系。
13 、The bis(S)-Naproxen methyl ester is(+)-enantiomer.───對其代謝過(guò)程作了初步探討。
14 、The conformational change of M. L. DNA with different methylation level was measured by CDD and UVD spectra.───L. DNA分離出來(lái).
15 、The applications of methyl trichlorosilane in the preparation of the.───一甲基三氯硅烷。
16 、I identified trace amounts of methyl aldehyde in the delivery system, aka formaldehyde.─── 我在緩釋系統中發(fā)現了 少量的甲醛 也就是福爾馬林
17 、Abnormal DNA methylation can influence the expression of certain genes,inducing occurrence and development in autoimmune diseases.───DNA甲基化異??捎绊懩承┗虻谋磉_,導致自身免疫性疾病的發(fā)生發(fā)展。
18 、Such as Vincristine Sulfate, Vinorelbine Bitartrate, NHDC and Hesperidin Methyl Chalcone.───例如硫酸長(cháng)春新堿、酒石酸長(cháng)春瑞憲,NHDC。
19 、The methylation specific PCR (MSP) and bisulfite DNA sequencing were performed to examine the methylation status of SLIT2 gene promoter.───亞硫酸氫鈉處理DNA,用MSP和測序法檢測SLIT2啟動(dòng)子甲基化狀態(tài)。
20 、Recent studies on DNA methylation and its regulatory enzymes,seem hot to researches of epigenetics.───DNA甲基化及其調節酶是近年來(lái)表觀(guān)遺傳學(xué)研究的熱點(diǎn)。
21 、A total of 74.6 kilograms of methyl amphetamine or 'ice' was seized in 1997, compared with 46.8 kilograms in 1996.───在一九九七年,共檢獲74.6公斤氧麻黃堿(或稱(chēng)"冰"),而在一九九六年則檢獲46.8公斤。
22 、In TGS in plants, cytoplasmic dsRNA containing promoter sequences is able to direct the silencing, and de novo methylation, of the homologous DNA.───在TGS的植物中,細胞質(zhì)的雙鏈RNA含有啟動(dòng)子序列,是能夠直接沉默,和去甲基化,同源的DNA 。
23 、As expected, tumor cells showed the highest methylation leels.───如所預料的一樣,腫瘤細胞呈高度甲基化。
24 、Thus the term dialkyl carbonate includes, for example, methyl ethyl carbonate.───因此術(shù)語(yǔ)二烷基碳酸酯包括,例如甲基乙基碳酸酯。
25 、Suppose you add a brief pulse of [3-14C] pyruvate (labeled in the methyl position) to the mitochondria.───假設你向線(xiàn)粒體中加入一個(gè)[3-14C]的丙酮酸(標記在甲基上)的短的脈沖。
26 、Su(ar)3-9 proteins attach methyl groups to the histone labeled H3 at its ninth amino acid residue, which is a lysine.───9蛋白將甲基加在組蛋白H3的第九位氨基酸殘基,也就是賴(lài)氨酸殘基上,從而使H3組蛋白貼上了個(gè)標簽。
27 、Methylation of TMS1/ASC gene in promotor region is related with the genesis of ovarian carcinoma.───TMS1/ASC基因啟動(dòng)子甲基化與卵巢癌發(fā)生的關(guān)系
28 、The group now aims to map the methylation patterns in 200 samples representing the entire human genome and all the major human tissues.───小組現在打算在代表整個(gè)的人類(lèi)基因組和所有的主要人類(lèi)組織的200個(gè)樣本中,來(lái)描繪映射甲基化型態(tài)。
29 、Z associates with functional regulatory elements, and CTCF marks boundaries of histone methylation domains.───Z和功能調控元件相關(guān),CTCF標記組蛋白甲基化區域邊界。
30 、The mechanism of methylation reaction is discussed.───對甲基化反應機理進(jìn)行了討論.
31 、Various overlay mediums, such as agar, starch gel, methyl cellulose and tragacanth are used.───常用的覆蓋培養基有:瓊脂、淀粉凝膠甲基纖維素和黃蓍膠等。
32 、Some methods could also determine the pattern of methylation or the degree of pectins acetylation.───其中有些方法可以同時(shí)測定果膠的甲酯的取代方式或**化取代度。
33 、Methylation of hMSH2 gene promoter CpG islands was not detected in gastric carcinoma or normal tissues.───hMSH2基因啟動(dòng)子CpG島在胃癌及正常組織中均未檢測到甲基化。
34 、Methods Methylation status of RASSF1A promoter was detected by MSP in 40 cases of breast cancer tissues and 24 cases of matched benign tissues.───因此認為RASSF1A基因的失活可能與腫瘤的發(fā)生有關(guān)。
35 、For example: Heavy lead, fusel oil, formaldehyde, methyl alcohol and so on.───如:重鉛、雜醇油、甲醛、甲醇等。
36 、After fusion of cytoplasm, the DNA methylation levels of the fused embryos was very high as well as two-cell diploid embryos in vivo.───在細胞核開(kāi)始融合的時(shí)候,甲基化水平急速下降,在細胞核完全融合的時(shí)候甲基化水平達到最低點(diǎn);
37 、They found fresh dirt on the tires with traces of arsenic, lead and methyl chloride.─── 輪胎上有新鮮泥土 其中含有砷 鉛 還有氯甲烷
38 、Cases with methylation of COX-2 and hMLH1 gene promoter CpG islands in gastric carcinoma were 8 and 13, and they were not detected in normal tissues.───COX-2和hMLH1基因啟動(dòng)子CpG島甲基化在43例胃癌中分別有8例和13例,正常組織中未檢測到。
39 、Methylation of hMLH1 and COX-2 gene promoter CpG islands may both occur in the development of MSI gastric carcinoma.───在MSI胃癌(尤其是MSI-H型胃癌)的發(fā)生、發(fā)展過(guò)程中可能同時(shí)出現了hMLH1和COX-2基因啟動(dòng)子CpG島的甲基化(即表型遺傳修飾)。
40 、Decreased RASGRF2 expression was presented in 36% (5/14) lung cancer cell lines while aberrant methylation of RASGRF2 was present in 29% (4/14) lung cancer cell lines.───RASGRF2 在 36% (5/14)的肺癌細胞中表達降低,而在 29% (4/14) 肺癌細胞中存在異常甲基化。
41 、CpG Methylation and Gene Regulation and Gene Regulation.───CpG甲基化與基因調控。
42 、It's rare around here, and I believe the methyl in the superglue ignited this rash.─── 在這兒很稀少 我覺(jué)得是強力膠引起了這些紅疹
43 、But another group was fed chow enriched with vitamin B12, folic acid and other good sources of methyl.───將**的橙腰鼠,一組喂食普通的飼料,其子代有60%出**的毛發(fā)。
44 、The characteristics of DOT1 proteins and H3K79 methylation suggest that they may have important and characteristic functions.───DOT1及H3K79甲基化的特點(diǎn)決定了其可能具有重要的、特殊的生物學(xué)功能。
45 、The methylation rate of hMLH1 gene promoter CpG islands in MSI-H was higher than that in MSS (P───在MSI-H組hMLH1基因啟動(dòng)子CpG島甲基化率顯著(zhù)高于MSS組(P
46 、The cream contains escin, hesperidine, methyl chalcone and coenzyme Q10.───乳液包含包含七葉皂素、橙皮苷、甲基酮和Q10。
47 、Produced from lauryl alcohol and methyl laurate.───以硬酯醇及甲基棕櫚。
48 、At first, ?I thought it was alien radiation markers I've never seen, foreign methyl groups.─── 一開(kāi)始我以為是什么外星人 上面有我從沒(méi)見(jiàn)過(guò)的輻射標記 還有外來(lái)的甲基原子團
49 、When the H3K9 methylation pathway is functioning properly, heterochromatin remains condensed and a single nucleolus forms around the ribosomal DNA.───當H3K9甲基化路徑正常是,異染色質(zhì)處于致密狀態(tài),在核糖體DNA周?chē)纬蓡蝹€(gè)核仁。
50 、The concordance between loss of expression and aberrant methylation of RASGRF2 was 86% (12/14) in cell lines.───RASGRF2 在肺癌細胞表達降低和異常甲基化的吻合率為86% (12/14);
51 、DNA methylation is a kind of normal endogenous modified mode,which is fulfilled by DNA methylation transferase.───DNA甲基化是真核生物DNA的正常內源性修飾方式,它由DNA甲基化轉移酶催化發(fā)生。
52 、Methyl silicone oil polysulfonate drilling fluid.───產(chǎn)。甲基硅油聚磺高密度鉆井液。
53 、ACR is a copolymer of methyl methacrylate with acrylate.───ACR是一種甲基丙烯酸甲酯與丙烯酸酯類(lèi)的共聚物。
54 、The frequency of p16 promoter methylation is higher in Dukes stages of C and D CRC (59%) than A and B CRC (20%)(p───p16基因啟動(dòng)子區甲基化在Dukes分期A(yíng)、B和C、D期中發(fā)生率分別為20%和59%,差異顯著(zhù)(p
55 、We will further investigate the relationship of histone modification and promoter methylation on the expression of TFPI-2.───今后,我們將在表觀(guān)遺傳層面對TFPI-2基因的修飾和相關(guān)組蛋白的修飾進(jìn)行深入研究。
56 、The genomic DNA methylation tends to repress gene expression while demethylation or hypomethylation activates the gene expression.───基因組DNA的甲基化修飾通常使基因轉錄失活,去甲基化或低甲基化則使基因轉錄活化。
57 、DNA methylation has also been found in premalignant lesions such as prostatic intraepithelial neoplasia, but to a less extent compared with that in prostate cancer.───前列腺癌前病變如前列腺上皮內瘤也存在DNA甲基化,但程度相對較低。
58 、Genes are imprinted by the addition of molecules called methyl groups to the gene's DNA.───基因印跡是通過(guò)在基因的DNA上鏈接附加的甲基團(一種分子的名稱(chēng))達成的。
59 、An organic compound, especially ethane, containing two methyl groups.───雙甲基的,乙烷一種有機化合物,特別是乙烷,內含有兩個(gè)甲基
60 、Methyl ethyl ketone. It's a solvent.─── 甲基乙基酮 是一種溶劑
61 、The other, called L-methionine, is a donor of methyl groups.───另一個(gè)是L-甲硫氨酸,它可以提供甲基。
62 、Just a scruffy white drifter who *elled like methylated spirits.─── 也只不過(guò)是個(gè)臟兮兮一身酒臭味的流浪漢罷了
63 、You were the cutout, you deliver the boat, he shoots you, and 300 gallons of burning methyl chloride cleans up the mess.─── 你來(lái)當替死鬼 把船送到 然后他給你一** 300加侖燃燒的氯甲烷就能毀尸滅跡
64 、Aberrant methylation of DNA has been recognized as common epigenetic changes in human cancer.───DNA異常甲基化是腫瘤常見(jiàn)的表觀(guān)遺傳學(xué)改變。
65 、The yield of dimethoxy methyl aceto acetate can be reached 55.3 %.───二甲氧基**乙酸甲酯的收率可達53.3%。
66 、DNA methylation has an important role in transcriptional regulation, togethering with histone modification and chromatin remodeling.───DNA甲基化在基因轉錄過(guò)程中扮有重要角色,并與組蛋白修飾、染色質(zhì)構型重塑共同參與轉錄調控。
67 、TMV CP;different constructs;methylation;post transcriptional gene silencing;watermelon;virus diseases;transformation;resistance.───不同結構形式;甲基化;轉錄后基因沉默;西瓜病毒病;轉基因;抗病性
68 、A polysaccharide of unknown structure was isolated, subjected to exhaustive methylation, and hydrolyzed.───一未知結構的多糖,經(jīng)完全甲基化和水解。
69 、We found that purified MPH have a 20-fold higher hydrolytic efficiency to methyl parathion than to parathion.───對MPH純酶的底物特異性研究中發(fā)現:它水解甲基對硫**的比活力是水解乙基對硫**比活力的20余倍。
70 、Various overlay mediums, such as agar, starchgel, methyl cellulose and tragacanth are used.───常用的覆蓋培養基有:瓊脂、淀粉凝膠甲基纖維素和黃蓍膠等。
71 、So the DNA methylation patterns of mouse tetraploid embryos are aberrant, which may lead to subsequent de-velopmental failure and embryo death.───因此, 小鼠體外培養四倍體胚胎的甲基化模式是不正常的, 這可能是四倍體小鼠難以發(fā)育到妊娠足月的原因之一。
72 、Produced from stearyl alcohol and methyl behenate.───可按客戶(hù)要求生產(chǎn)。
73 、Produced from stearyl alcohol and methyl palmitate.───以硬酯醇及甲基二十二。
74 、In this case, methyl alcohol will be excreted unmetabolized in the urine.───在這種情況下,甲醇將以原形隨尿排除。
75 、DNA methylation is an important epigenetic modification of the mammalian genome that regulates gene expression and chromatin organization.───DNA甲基化是對哺乳動(dòng)物基因組一種重要的表觀(guān)遺傳修飾,調控著(zhù)基因表達和染色質(zhì)組織結構。
76 、CFTR and GSTP1, have aberrant high methylation profiles in HCC by contrast with the unmethylated normal controls.───CFTR基因和GSTP1基因在正常肝組織中均未甲基化,而在癌旁組織和癌組織中甲基化比例較高。
77 、The kinetics of graft copolymerization of SBS and methyl methacrylate in toluene initiated by BPO was investigated.───以過(guò)氧化苯甲酰(BPO)為引發(fā)劑,甲苯為溶劑,膨脹計法研究甲基丙烯酸甲酯與SBS接枝聚合反應動(dòng)力學(xué)。
78 、Pseudomonas putida DLL-1 is a high effective methyl parathion(MP) degrading strain,which is also of chemotaxis to MP.───Pseudomonas putida DLL-1是一株甲基對硫**(MP)高效降解菌株,同時(shí)對MP具有趨化性。
79 、In the development of leukemia, methylation plays an important role in the genetic expression regulation and genetic structure stabilization.───在白血病的發(fā)展中,甲基化對基因表達的調控和基因結構的穩定起著(zhù)重要的作用。
80 、DNA methylation plays a key role in transgene silencing.───DNA甲基化是引起外源基因沉默的主要原因。
81 、Methanol, ethanol and glycolic methyl ether as precursor solvent of boric acid.───對上述體系中不同的先驅體及溶劑進(jìn)行交叉實(shí)驗。
82 、DNA methylation and its aberrance play an important role in the human development and tumorigenesis.───DNA的甲基化及甲基化異常在人體發(fā)育和腫瘤的發(fā)生中起著(zhù)至關(guān)重要的作用。
83 、In benzene or ethyl acetate solution rates increase linearly with methyl methacrylate concentration.───在苯或乙酸乙酯溶液中其衰減速度隨甲基丙烯酸甲脂濃度呈直線(xiàn)地增大。
84 、The working solution is made by mixing 1 part of the stock solution with 6 to 8 parts of methyl alcohol.───工作用液是1份儲備液和6-8份甲醇配成的。
85 、Our data show that 5 aza CdR may inhibit tumor growth by reactivating growth regulatory genes silenced by de novo methylation.───5 aza CdR有肯定的抑瘤作用 ,其抑瘤作用的可能機理主要是通過(guò)p16基因去甲基化解除轉錄抑制完成的。
86 、Allene is an isomer of methyl acetylene.───丙二烯是甲基乙炔的一種異構體。
87 、Alterations in DNA methylation, an important regulator of gene transcription, lead to cancer.───對調節基因轉錄起重要作用的DNA甲基化的異常將導致癌癥的發(fā)生。
組蛋白甲基化修飾(Histone Lysine Methylation)
染色質(zhì)的精細調色板:組蛋白甲基化的作用與動(dòng)態(tài)平衡
在真核生物的基因舞臺上,組蛋白甲基化(組蛋白H3和H4的N端尾部的賴(lài)氨酸或精氨酸被甲基化修飾),這一過(guò)程由組蛋白甲基轉移酶(HMTs)精細操控,如同藝術(shù)家手中的畫(huà)筆,將S-腺苷甲硫氨酸(SAM)的甲基巧妙地添加到DNA的守護者上。賴(lài)氨酸可接納一至三個(gè)甲基,精氨酸則可被加上一或兩個(gè),這些看似微小的變化,卻在基因表達的調色板上產(chǎn)生了深遠影響。
核小體的動(dòng)態(tài)核心
作為染色質(zhì)的基本組件,核小體由H3-H4和H2A-H2B二聚體構成,最初被認為是DNA的靜態(tài)框架。然而,現代研究揭示,組蛋白并非靜止不變,它們通過(guò)甲基化等翻譯后修飾,參與到細胞核的多種功能調控中,尤其是賴(lài)氨酸甲基化,成為決定基因組結構和活性的關(guān)鍵開(kāi)關(guān)。
賴(lài)氨酸甲基化:三種狀態(tài)與命運決定
賴(lài)氨酸的甲基化狀態(tài)——單、二、三甲基化,如同基因組的密碼,與不同的核活性和轉錄狀態(tài)緊密相連。通過(guò)賴(lài)氨酸甲基轉移酶(KMTs)的精細操作和去甲基化酶(KDMs)的調節,這些變化在細胞層面刻畫(huà)了基因的開(kāi)啟與關(guān)閉。
抗癌策略的基石:組蛋白去甲基化酶
其中,一些去甲基化酶,如KDM2/7,擁有抗癌潛力,它們抑制了過(guò)度的甲基化,恢復基因的正常表達。HMTs和KDMs的特異性識別和作用,共同構建了染色質(zhì)調控的精密網(wǎng)絡(luò )。
組蛋白甲基化:基因表達的指揮棒
甲基化程度和位置決定了基因的轉錄命運。H3K4me2、me3和H3K79me3傾向于激活,而H3K9me2、me3、H3K27me2、me3和H4K20me3則抑制,它們還參與DNA修復,與相關(guān)蛋白形成動(dòng)態(tài)協(xié)作。
賴(lài)氨酸甲基化在性別決定與疾病中的角色
在雌性哺乳動(dòng)物中,X染色體的去活化過(guò)程中,組蛋白H3K9me3、H3K27me3等位點(diǎn)的甲基化至關(guān)重要,它們通過(guò)與Xist RNA的結合,將X染色體塑造成異染色質(zhì),這一過(guò)程的失調與多種癌癥的發(fā)展緊密相關(guān)。
通過(guò)深入理解組蛋白甲基化這一生物化學(xué)機制,我們得以窺探生命的復雜性,揭示基因表達調控的深層邏輯。賴(lài)氨酸甲基化,這一看似微不足道的修飾,實(shí)則在細胞的每一絲基因活動(dòng)背后發(fā)揮著(zhù)至關(guān)重要的角色。
人類(lèi)早期胚胎發(fā)育DNA甲基化景
人類(lèi)早期胚胎發(fā)育DNA甲基化圖景——表觀(guān)遺傳學(xué)—胚胎發(fā)育系列第1篇
DNA甲基化是一種重要的表觀(guān)遺傳修飾在基因轉錄表達、基因印記的維持、X染色體失活和轉座子元件的表達等一系列生物學(xué)過(guò)程中扮演重要的角色。
哺乳動(dòng)物中最具有戲劇性的表觀(guān)組變化發(fā)生在原始生殖細胞和胚胎植入前的發(fā)育過(guò)程。
為了獲取人類(lèi)早期胚胎的DNA甲基化圖譜,作者使用全基因組簡(jiǎn)化甲基化測序(RRBS)和全基因組甲基化測序(WGBS)技術(shù)對人類(lèi)配子和植入前后的 胚胎進(jìn)行了研究。
本研究使用的材料如下:
使用的材料為極體(polar body)、成熟卵母細胞(oocytes)和第一極體、合子(zygotes)、 2細胞、4細胞、8細胞、桑椹胚(morula)、內細胞團(inner cell mass,ICM)和囊胚階段的滋養層細胞(trophectoderm cells,TE),此外還有精細胞。
不同類(lèi)型細胞的DNA甲基化水平聚類(lèi)顯示,不同類(lèi)型細胞間有各自獨特的甲基化特征。
例如:極體和卵母細間的甲基化狀態(tài)相似,而與其他類(lèi)型細胞差別較大;精細胞甲基化狀態(tài)與其他類(lèi)型細胞有明顯的區別;2細胞-TE發(fā)育過(guò)程中甲基化狀態(tài)變化比較平穩。
在基因體(gene body)層面和不同發(fā)育階段層面,不同類(lèi)型、發(fā)育時(shí)期細胞的甲基化轉態(tài)變化明顯。
小鼠中甲基化擦除主要發(fā)生在合子-2細胞過(guò)程,而人類(lèi)胚胎發(fā)育中去甲基化和甲基化重建又有什么特點(diǎn)呢?不同的基因組區域的甲基化水平變化是否同步?
對不同CpG含量的啟動(dòng)子(HCP、ICP、LCP)、CpG島(CGI)、外顯子(Exon)、內含子(Intron)、基因(Intragenic)、基因間區(Intergenic)、轉座子元件(細分為SINE、LINE、LTR)和增強子(Enhancer)的甲基化水平進(jìn)行計算,繪制動(dòng)態(tài)發(fā)育過(guò)程甲基化水平的變化。
結果發(fā)現,整體上不同基因組區域的甲基化動(dòng)態(tài)變化相似,說(shuō)明胚胎發(fā)育過(guò)程中全基因組的甲基化變化趨勢一致,是一個(gè)統一的過(guò)程。但也能發(fā)現高CpG的區域如CGI和HCP一直是去甲基化狀態(tài)且甲基化水平相對穩定。
此外,對第1極體和第2極體的甲基化水平進(jìn)行比較,二者從卵母細胞取出的過(guò)程是對甲基化狀態(tài)產(chǎn)生了影響以及二者是否本身就存在較大的甲基化水平的差異。
結果發(fā)現,第1、2極體和卵母細胞的甲基化水平差別不大,說(shuō)明從卵母細胞中擠壓出極體的過(guò)程中沒(méi)有產(chǎn)生全基因組甲基化的非對稱(chēng)性。
有文獻報道小鼠中卵母細胞中non-CpG的DNA甲基化水平,而人類(lèi)卵母細胞尚未有相關(guān)報道。
繪制gene body側翼non-CpG甲基化曲線(xiàn)發(fā)現,non-CpG甲基化水平較低,gene body的甲基化水平明顯高于側翼,且整體分布形態(tài)和CpG甲基化模式相似。
不同類(lèi)型胞嘧啶的甲基化水平存在差異那么,DNA甲基化水平和胞嘧啶的密度是否存在關(guān)系?
胚胎發(fā)育過(guò)程中甲基化發(fā)生了劇烈的變化,那么去甲基化的過(guò)程中父源和母源基因組的甲基化動(dòng)態(tài)如何呢?
使用單細胞RRBS技術(shù)對分離出的父源、母源的原核進(jìn)行測序,并分析了DNA甲基化水平的動(dòng)態(tài)變化。
可見(jiàn),父源和母源的原核的甲基化動(dòng)態(tài)變化非常的劇烈且并不一致。配子階段精細胞甲基化水平較卵母細胞稍高,顯微注射后的數十個(gè)小時(shí)里發(fā)生了較大的變化,父源和母源原核甲基化水平迅速下降,父源的去甲基化程度更大,最終父源的甲基化水平比母源的要低形成反轉,免疫熒光染色也證實(shí)了這一點(diǎn)。
接下來(lái),對精細胞和卵母細胞的甲基化相似性和差異性進(jìn)行了分析。使用固定長(cháng)度區域(100bp)來(lái)計算全基因組的tile甲基化水平,并分別對高甲基化(≥75%)和低甲基化(≤25%)區域進(jìn)行分析。
分析高甲基化和低甲基化區域的分布特點(diǎn)發(fā)現,高甲基化區域顯著(zhù)富集于SINE和LINE等轉座子元件,用于抑制轉座元件的轉錄活性。而低甲基化區域富集于HCP、增強子、外顯子和CpG島,用于維持胚胎發(fā)育。
此外,還對卵母細胞和精細胞間的差異甲基化區域(differentially methylated regions,DMR)進(jìn)行了研究,分別鑒定出了17,473個(gè)精細胞特異的DMRs和12,145個(gè)卵母細胞特異的DMRs。
接下來(lái),對DNA甲基化與組蛋白修飾間的關(guān)系進(jìn)行了探討。
結果發(fā)現,胚胎干細胞和ICM階段H3K27me3區域通常富含低水平的DNA甲基化,配子和中間的發(fā)育階段同樣存在低甲基化的現象。
隨后,對基因表達和DNA甲基化間的關(guān)系進(jìn)行探討。
分別對基因體和啟動(dòng)子的甲基化水平與基因表達量間的相關(guān)性進(jìn)行了計算,結果發(fā)現,基因和啟動(dòng)子的 甲基化水平與基因的表達量呈負相關(guān)的關(guān)系,且發(fā)育后期的負相關(guān)性越來(lái)越高。這說(shuō)明,在DNA甲基化的擦除和重建的各個(gè)階段,啟動(dòng)子的DNA甲基化仍然會(huì )抑制相關(guān)基因的表達。
最后,對DNA甲基化是如何抑制轉座子元件的機制進(jìn)行了探討。以常見(jiàn)的長(cháng)散在重復序列(LINE)和短散在重復序列(SINE)進(jìn)行了探討。
在不同發(fā)育階段,重復元件的表達與DNA甲基化的區域呈現負相關(guān)。胚胎發(fā)育早期DNA甲基化被擦除,重復元件的表達水平提升,后期DNA甲基化水平重建重復元件的表達水平被強烈抑制,維持較低的水平(圖a,c)。此外,Alu、MIR、L1和L2的平均甲基化水平符合全基因組甲基化水平的變化。
本文對人類(lèi)早期胚胎不同發(fā)育階段樣本的DNA甲基化水平進(jìn)行了探討,對DNA甲基化、組蛋白修飾、基因表達和轉座子元件間的關(guān)系進(jìn)行了研究。
人類(lèi)早期胚胎發(fā)育的各個(gè)階段全基因組的甲基化水平發(fā)生了劇烈的變化,發(fā)生了從去甲基化到甲基化重建的過(guò)程;不同發(fā)育階段的細胞有其特有的差異甲基化區域;DNA甲基化與不類(lèi)型的組蛋白修飾有完全不同的相關(guān)性,說(shuō)DNA甲基化和不同類(lèi)型的組蛋白修飾各自調控著(zhù)一套基因集;轉座子元件和DNA甲基化關(guān)系也十分密切,同樣經(jīng)歷了擦除和重建的過(guò)程;另外,DNA甲基化的狀態(tài)同時(shí)影響了基因的表達,尤其是發(fā)育后期啟動(dòng)子區域的甲基化與基因表達的負相關(guān)性明顯增強。
總之,該文系統的研究了人類(lèi)早期胚胎發(fā)育不同階段的DNA甲基化情況,首次展示了人類(lèi)早期胚胎的表觀(guān)圖景,為以后深入研究胚胎發(fā)育機制奠定了基礎。
The DNA methylation landscape of human early embryos. NATURE. 2014. doi:10.1038/nature13544
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