rapd縮寫(xiě)是什么意思

RAPD英文含義

1、RAPD的英文全稱(chēng)：relative afferent pupillary defect (ophthalmology; aka Marcus-Gunn Pupil) | 中文意思：───相對傳入瞳孔缺陷（眼科；又名馬庫斯·岡恩瞳孔）

2、RAPD的英文全稱(chēng)：Randomly Amplified Polymorphic DNA | 中文意思：───隨機擴增多態(tài)DNA

3、RAPD的英文全稱(chēng)：Randomly Amplified Polymorphism DNA | 中文意思：───隨機擴增多態(tài)性DNA

4、RAPD的英文全稱(chēng)：relative afferent pupillary defect (ophthalmology; aka Marcus-Gunn Pupil) | 中文意思：───相對傳入瞳孔缺陷(眼科；也就是上瞼下垂合并的學(xué)生)

5、RAPD的英文全稱(chēng)：Rapid Application Protocol Driver | 中文意思：───快速應用程序協(xié)議驅動(dòng)程序

6、RAPD的英文全稱(chēng)：Resource For Algorithm For Preprocessing The Database | 中文意思：───數據庫預處理算法資源

7、RAPD的英文全稱(chēng)：Relative Afferent Pupillary Defect | 中文意思：───相對傳入瞳孔缺陷

8、RAPD的英文全稱(chēng)：Random amplified polymorphic DNA | 中文意思：───隨機擴增的多態(tài)性DNA

9、RAPD的英文全稱(chēng)：Randomly Amplified Polymorphic DNA (aka Random Amplification of Polymorphic DNA) | 中文意思：───隨機擴增DNA多態(tài)性(即隨機擴增多態(tài)性DNA)

標記和性狀共分離什么意思

標記和性狀共分離：在有性繁殖的后代,假如基因附近有一緊密連鎖的分子標記,在細胞減數分裂時(shí)分子標記與基因之間由于相距太近很少有機會(huì )發(fā)生交換。

標記和性狀共分離如果目的片段存在一個(gè)突變，則所有大于某一大小對應于突主變位置的雙脫氧終止片段無(wú)野生型系統，對于每一個(gè)突有多次機會(huì )檢測其遷移率改變，提高了檢測突變的效率。

ddF方法克服了SSCP分析時(shí)因DNA長(cháng)度影響SSCP顯示的困難，通過(guò)一種雙脫氧核昔酸生產(chǎn)特異性的單鏈DNA，使其中長(cháng)度合適的DNA片段顯示SSCP改變。

標記和性狀共分離隨機擴增多態(tài)性DNA：

它是利用隨機引物（一般為8—10bp）通過(guò)PCR反應非定點(diǎn)擴增DNA片段，然后用凝膠電泳分析擴增產(chǎn)物DNA片段的多態(tài)性。擴增片段多態(tài)性便反映了基因組相應區域的DNA多態(tài)性。RAPD所使用的引物各不相同。

但對任一特定引物，它在基因組DNA序列上有其特定的結合位點(diǎn)，一旦基因組在這些區域發(fā)生DNA片段**人、缺失或堿基突變，就可能導致這些特定結合位點(diǎn)的分布發(fā)生變化，從而導致擴增產(chǎn)物數量和大小發(fā)生改變，表現出多態(tài)性。

就單一引物而言，其只能檢測基因組特定區域DNA多態(tài)性，但利用一系列引物則可使檢測區域擴大到整個(gè)基因組，因此，RAPD可用于對整個(gè)基因組DNA進(jìn)行多態(tài)性檢測，也可用于構建基因組指紋圖譜。

請問(wèn)，雙假測交理論是什么能說(shuō)詳細點(diǎn)最好。

分子標記指可遺傳并可檢測到的DNA序列或蛋白質(zhì)。蛋白質(zhì)標記主要是指同工酶、等位酶、貯藏蛋白等等，本文主要介紹DNA標記。理想的分子標記應具有以下幾個(gè)條件：①以孟德?tīng)柗绞竭z傳。②多態(tài)性好，自然條件下存在許多變異位點(diǎn)。③遍布整個(gè)基因組，能夠檢測到整個(gè)基因組的變異。④共顯性遺傳，即可以區別純合體和雜合體。⑤表現“中性”，即不影響目標性狀的表達。⑥重復性好，便于資源共享。⑦自動(dòng)化程度高。近年來(lái)，關(guān)于分子標記的研究進(jìn)展很快，本文僅就分子標記在果樹(shù)研究中的應用及存在問(wèn)題做一介紹，并對應用前景做一展望。

一、分子標記在果樹(shù)研究中的應用：

1.分子標記在種質(zhì)資源研究中的應用。

（1）系譜分析和分類(lèi)。物種在進(jìn)化過(guò)程中，其DNA是一個(gè)漸變的過(guò)程。遺傳關(guān)系越近，基因組DNA的差異越小，反之，差異越大。HARADA T等用RAPD標記對兩個(gè)三倍體蘋(píng)果品種“喬納金”和“陸奧”進(jìn)行了分析，結果表明，作為母本的金冠提供了減數的二倍體配子。沈向等對杏進(jìn)行了RAPD分析，將41個(gè)品種分為5類(lèi)。

（2）種質(zhì)保存和核心種質(zhì)的建立。如何事理有效地管理和利用種質(zhì)資源，當今世界出現了兩種趨勢，其中之一就是建立核心種質(zhì)。目的是以最少的種質(zhì)樣品重復而最大地包含一個(gè)種及其野生種的遺傳多樣性。分子標記為人們提供了一個(gè)有效、快速的途徑。目前已建立的核心種質(zhì)涉及到谷物、豆類(lèi)、牧草、蔬菜和果樹(shù)等。AMY K SZEWC-MCFADDEN等用SSR結合園藝性狀建立了蘋(píng)果的核心種質(zhì)，HOKANSON等也建立了蘋(píng)果核心種質(zhì)。

（3）構建指紋圖譜和品種鑒別。高質(zhì)量的指紋圖譜可作為新品種登記、注冊和產(chǎn)權保護的重要依據。特別是對于無(wú)性繁殖的果樹(shù)來(lái)說(shuō)，同物異名、同名異物現象很?chē)乐?，利用分子標忘本中高效、準確地建立指紋圖譜、鑒別果樹(shù)品種。張潞生利用AFLPs建立了清晰的狒猴桃的指紋圖譜，宋婉建立了棗優(yōu)良品種的DNA指紋圖譜。祝軍對蘋(píng)果進(jìn)行了AFLP分析，得到了蘋(píng)果的DNA指紋圖譜，劉孟軍對棗和酸棗進(jìn)行了FRAPD分析，將親緣關(guān)系極近的金絲小棗和無(wú)核小棗區分開(kāi)。

（4）體細胞雜種和外源基因滲入的鑒定。利用分子標記可在試管苗期快速、準確地對體細胞雜種進(jìn)行鑒定。史永忠對柑橘進(jìn)行了體細胞雜種鑒定，認為體細胞雜種表現為雙親譜帶之和。另外，珠心胚現象使柑橘合子苗與珠心苗在苗期很難鑒別，嚴重陰礙柑橘的雜交育種，LURO對檸檬的實(shí)生后代RAPD分析指出，雜交合子苗由于有外源基因的滲入，譜帶比珠心苗多。

2.構建分子遺傳圖譜。

在人類(lèi)基因組計劃的推動(dòng)下，新西蘭和歐洲的兩個(gè)“蘋(píng)果基因組”計劃已經(jīng)啟動(dòng)，同時(shí)美國、歐洲也啟動(dòng)了李屬植物的基因組作圖工程。目前已經(jīng)建立或初步建立了基因組圖譜（險人類(lèi)基因組圖譜為物理圖譜外，最近中科院基因研究中心構建了高分辨率的水稻基因組物理圖譜，其它絕大多數為遺傳連鎖圖譜）的果樹(shù)有蘋(píng)果、桃、櫻桃、扁桃、核桃、草莓、葡萄、柑橘、香蕉等十幾種。

建立遺傳連鎖圖譜，首先要有一個(gè)作圖群體。作圖的群體主要有F2、F3、BC等。除此之外，單倍體也可應用于果樹(shù)基因組作圖?！皢文吮尽辈呗宰畛鮼?lái)源于對人的精子的研究，后來(lái)用于對針葉松(用大配子群體)和斑馬魚(yú)的胚胎研究上。STOCKINGER等以孢子來(lái)源的愈傷培養群體為試材，做了甜櫻桃的遺傳連鎖圖譜。他認為，以單倍體為試材，大多數隨機引物擴增中不能標記的雜和位點(diǎn)不會(huì )發(fā)生，可以促進(jìn)連鎖圖譜的建立。陳洪、李平等利用雙單倍體(DH)進(jìn)行水稻基因組作圖，指出：F2代或BC1群體，不能通過(guò)種子傳代維持，所以難以進(jìn)一步發(fā)展已建成的圖譜，而DH株系為一個(gè)永久性的作圖群體，而且RAPD特別適于DH群體作圖。

HEMMAT M等針對蘋(píng)果和其他異型雜交的物種，因無(wú)性繁殖而且種內雜交受抑以至于很難有可利用的自交或回交群體用于作圖這一事實(shí)，提出了“雙假測交”(Double pseudotestcross)的構想?！半p假測交”設想最初應用于同工酶上，HEMMAT將之擴展至RFLP和RAPD技術(shù)，利用蘋(píng)果“Rome Beauty”與“White Angel”雜交，獲得F1代，為父、母本分別作圖，獲得兩張遺傳連鎖圖譜。PATRICK J C等利用“雙假測交”的構想做了三張連鎖圖譜，其中“Wijcik Mclntosh”的圖譜包括238標記，分布于19個(gè)連鎖群，覆蓋基因組1206 cM；“NY75441—67”的圖譜有110個(gè)標記，分布于16個(gè)連鎖群，“NY 75441—58”的圖譜有183個(gè)標記，分布于18個(gè)連鎖群。主要為RAPD標記，另外還有6個(gè)同工酶標記，4個(gè)形態(tài)學(xué)標記(Rf：果皮顏色；Vf：黑星??；Co：柱狀生長(cháng)習性；Ma：蘋(píng)果酸)，標記之間的平均距離為5．0cM。

作圖群體確定后，采用分子標記對作圖群體進(jìn)行分析。對于獲得的標記進(jìn)行“適合性測驗”，不符合孟德?tīng)栠z傳的標記不能用于作圖。劉孟軍以蘋(píng)果為試材研究了種間雜交一代的分離方式，結果表明有8．0％的標記偏離孟德?tīng)柗蛛x比例，1．5％的標記屬異常分離(雙親有而后代沒(méi)有的標記或隔代遺傳的標記)。類(lèi)似的結果在桃、核桃上也有報道，這種分離異常的原因可能與受粉、受精異常有關(guān)，另一解釋是群體太小或取樣有誤差。所以作圖群體一般為50～200個(gè)。

“雙假測交”構想中，對于父本表現為雜合而對母本表現為純合隱性的標記用于父本作圖，對于母本表現為雜合而對父本表現為純合隱性的標記用于母本作圖。對于父、母本均表現為雜合的標記可用以確定雙親連鎖圖中的同源連鎖群。對于以共顯性RFLP和等位酶為作圖手段時(shí)，符合1∶2∶1和1∶1分離比例的標記用于作圖以RAPD為作圖手段時(shí)，符合3∶1和1∶1分離比例的標記用于作圖。用RAPD技術(shù)以單倍體群體為作圖群體時(shí)，符合1∶1或1∶2或2∶1的分離比例，標記用于作圖。因為較高比值的標記可能是由于分離異?；蚍沁B鎖片段的共遷移而形成的，所以不作為可遺傳的標記，對于只在一親本中為雜合而在另一親本為純合的位點(diǎn)，其F1代按1∶1分離，此時(shí)RAPD能提供與共顯性標記RFLP一樣的信息量。采用的標記種類(lèi)對作圖有一定影響，POWELL等提出了MI(Marker index)值的概念，指每個(gè)反應的多態(tài)性產(chǎn)物的數量。即MI值越大，多態(tài)性越好。就MI值而言，幾種分子標記按MI值由大到小依次為AFLPs、SSRs、RAPDs、RFLPs。故此可利用幾種分子標記結合起來(lái)用于建立高密度的連鎖圖譜。

3．基因連鎖標記的尋找與基因**。

基因**是獲得有利基因的重要條件，對于大多數果樹(shù)來(lái)說(shuō)，目前還不能進(jìn)行準確的基因**，所以當務(wù)之急是尋找與基因連鎖緊密的分子標記。標記目標性狀基因，可以用的群體主要有兩種：一是利用近等基因系(NIL，near-isogenic line)，二是利用分離群體分組分析(BSA，Bulk segregant analysis)。近等基因系是指只有目標性狀基因有差異，其它性狀基因相同的兩個(gè)群體。近等基因系是通過(guò)不平衡雜交獲得的。所以在果樹(shù)上是很難獲得的。目前果樹(shù)上主要是利用BSA法，BSA法的具體做法是：將分離群體中研究的目標性狀根據其類(lèi)型(如抗病、感病)分成兩組，將每組內一定數量的植株DNA等量混合，形成兩個(gè)池，這兩個(gè)池除在目標性狀(抗病性)上有差異外，其余遺傳背景均相同。利用分子標記技術(shù)尋找兩個(gè)池的擴增譜帶的差異，這種多態(tài)性極可能與目標基因連鎖。再用所有的分離后代單株，驗證該多態(tài)性是否真正與目標基因連鎖及連鎖距離的確定。如果分離群體不易獲得，可采取混合樣品法。以抗病性為例，即盡可能地把所有的抗病品種的DNA等量混合，作為一個(gè)基因池；把所有的感病品種的DNA等量混合，作為一個(gè)基因池，對兩個(gè)基因池的DNA多態(tài)性進(jìn)行分析，但是這種方法不能進(jìn)行遺傳距離的計算，彭建營(yíng)利用混合樣品法找出了一個(gè)可能與棗無(wú)核性狀相關(guān)的DNA片段。另外，果樹(shù)上很多性狀為數量性狀，對于控制數量性狀的QTLs(Quan-titative trait loci)的尋找，分子標記提供了非常方便快捷的方法。NANDIS等人利用AFLP和選擇基因型(Se-lective genotyping)，為控制水稻抗澇的QTLs**。并指出選擇基因型對于QTLs的**提供了一條快速容易的途徑。選擇基因型指在RIL群體中，選擇目標性狀是兩極(如特抗澇、對澇極敏感)的個(gè)體來(lái)進(jìn)行DNA多態(tài)性分析。除了選擇基因型外，間隔作圖(Interval mapping)，后代測定和同時(shí)搜尋(Progeny testing and simul-taneous search)，均有利于提高QTLs作圖的準確度和效率。另外，還可以利用已有的連鎖圖進(jìn)行標記，一旦發(fā)現某一目標基因被**在某一染色體上，就可以選擇分散在染色體不同位點(diǎn)上的標記，進(jìn)行染色體滑步(Chromosomewalking)，直至找到目標基因。

日前，已在各種果樹(shù)上找到了與主要性狀基因連鎖的標記。

4.MAS(Marker-assisted selection)。MAS是分子標記在育種上的一個(gè)重要應用。當與目標基因相連鎖的分子標記和 目標基因相距5cM之內時(shí)，即可用于MAS。目前果樹(shù)上可用做MAS的標記不是很多。MAS可以跟蹤、檢測外源基因、進(jìn)行全基因組選擇，輔助選擇同效基因的累加，尤其是在抗病性選擇上，MAS提供了一個(gè)準確、快速的方法。利用與抗病基因緊密連鎖的分子標記，可在無(wú)病侵染條件下，進(jìn)行早期抗病性鑒定，無(wú)須后代測定即可進(jìn)行重疊抗性基因的組建。有關(guān)MAS的效率有人作過(guò)研究，指出：用與互斥相(Kepulsion-phase)連鎖的標記可提高M(jìn)AS的效率。另外以純合互斥相和互引相的RAPD標記的表現型為基礎的個(gè)體選擇與以共顯性的標記(RFLPs)為基礎的選擇、僅用互斥相標記的選擇是相似的。再有，當用于重組近交系上時(shí)，以連鎖的RAPD標記為基礎的MAS與以RFLP標記為基礎的MAS的效率相似，因為重組近交系的雜合水平最小。

雖然MAS在理論上對植物改良有益，但在實(shí)踐上還未見(jiàn)成功報道。限制應用的因素主要有以下幾個(gè)方面：①連鎖群中探測到的與目標性狀緊密連鎖的分子標記位點(diǎn)的數目；②探測低遺傳率的數量性狀所需群體的大??；③由確定多個(gè)分子標記位點(diǎn)的權重而帶來(lái)的取樣誤差；④表型信息和獲得每單位信息量的費用。

5.雜種優(yōu)勢預測。

雜種優(yōu)勢來(lái)源于親本有利基因的雜合性。由于在某種程度上，兩親本品系具有與雜種優(yōu)勢有關(guān)的DNA區域純合度較高，其F1代雜種優(yōu)勢就可能越大。所以可以根據各品系在這些可能與雜種優(yōu)勢有關(guān)的DNA區域上的多態(tài)性，構建雜種優(yōu)勢群，指導雜交組合的選配和雜種優(yōu)勢的分析和預測。ZHANG等用RFLP和SSR標記對水稻的雜種優(yōu)勢作了雙列分析，在果樹(shù)上尚未見(jiàn)有這方面的報道。除以上用途外，分子標記還可用于基因的克隆，即根據重要農藝性狀的標記及基因組圖譜，采用染色體滑步法(Chromosome walking)等手段克隆基因。目前，果樹(shù)上已克隆的基因至少有蘋(píng)果、獼猴桃的ACC氧化酶基因，藍莓的抗旱抗低溫蛋白基因，葡萄的控制果實(shí)顏色的基因。蘋(píng)果抗性基因的克隆研究較多，一旦抗性基因被克隆，這些基因就可能轉到其他的品質(zhì)優(yōu)良但抗性差的品種中去，這對蘋(píng)果的抗性育種無(wú)疑將是一次革命。

二、存在問(wèn)題及前景展望：

果樹(shù)研究的一個(gè)主要目標就是培育優(yōu)質(zhì)抗病的優(yōu)良品種，對于多年生果樹(shù)來(lái)說(shuō)，由于其高度雜合、自交不親和、育種周期長(cháng)等特點(diǎn)，傳統的育種方法盲目性很大。獲得控制主要經(jīng)濟性狀的基因，進(jìn)而能調控這些基因的表達，成為幾代果樹(shù)育種工作者的夢(mèng)想。而分子標記的應用給果樹(shù)育種注入了新的活力。在蘋(píng)果基因組計劃和李屬植物基因組計劃的有力推動(dòng)下，一系列的分子連鎖圖譜已經(jīng)建成。高密度的分子連鎖圖譜對于基因**、基因克隆及MAS意義重大。然而同其它農作物相比，果樹(shù)的遺傳連鎖圖譜飽和度及可用于MAS的標記數目還有待于增加。

以基因組作圖為中心的基因組學(xué)發(fā)展很快。近幾年又出現了一門(mén)新的學(xué)科——比較基因組學(xué)(Compar-ative mapping)。經(jīng)研究證明：禾谷類(lèi)物種之間基因組較保守，染色體上的基因順序和含量有一定相似性，比較基因組學(xué)正是基于這樣一種事實(shí)而發(fā)展起來(lái)的。比較基因組學(xué)為進(jìn)化研究、飽和遺傳圖譜的建立、直向同源基因(Orthologus genes)基于圖譜的克隆提供了有力手段，一旦某同源基因被克隆和測序，信息可很快用于其它植物上同源基因的克隆。隨著(zhù)不同實(shí)驗室李屬植物遺傳連鎖圖譜的初步建立，作圖的下一步要涉及到各圖譜的比較和統一，目的在于產(chǎn)生該物種的較為完整的圖譜。目前以桃的基因組克隆做探針在歐洲酸櫻桃上研究表明：50％的桃的基因組克隆導致了歐洲酸櫻桃RFLPs的產(chǎn)生，另外，桃第三個(gè)連鎖群上緊密連鎖的兩個(gè)RFLP標記B4A9和B7A5在歐洲酸櫻桃上也緊密連鎖。以上研究結果無(wú)疑對李屬乃至整個(gè)果樹(shù)比較基因組的研究提供了良好的開(kāi)端。

隨著(zhù)分子標記手段的不斷更新和基因組圖譜的日趨飽和，其應用也隨之向深度和廣度推進(jìn)，分子生物學(xué)又出現了“功能基因組學(xué)”(Function genomics)和后基因組學(xué)(Post genomics)，主要是研究基因結構、表達和調控。隨之而產(chǎn)生的DNA芯片技術(shù)(DNA chip)和信使RNA差異顯示技術(shù)(Messenger RNA differentialdisplay，mRNA DD)為基因的**、表達研究提供了嶄新工具，相信在人類(lèi)基因組計劃的強大推動(dòng)下，在水稻、小麥等農作物基因組研究的影響下，分子標記在果樹(shù)的應用研究必將迎來(lái)一個(gè)迅速發(fā)展的時(shí)代。